まずは返信したいツイートにマウスカーソルを乗せましょう。すると上記イメージのように、ツイート下部にメニューが表示されますので、1の返信ボタンを押しましょう。

すると上記イメージのような返信BOXが表示されます。

返信BOXに返信文章を記載し2のツイートボタンを押しましょう。

たったこれだけで、ツイートへの返信は完了です。上記イメージのようにツイートの下にあなたのツイートが出ていれば返信は成功です。